नायलॉन 66 आमतौर पर नायलॉन 6 की तुलना में अधिक मजबूत होता है। नायलॉन 66 के अणुओं की नियमित श्रृंखला व्यवस्था, उच्च क्रिस्टलीयता और प्रभावी हाइड्रोजन बांड के कारण अंतर-आणविक बल मजबूत होते हैं। जब बाहरी बल लगाया जाता है, तो क्रिस्टलीय क्षेत्र बाहरी बल को प्रभावी ढंग से वहन करते हैं और तनाव को समान रूप से वितरित करते हैं, जिससे नायलॉन 66 की उत्कृष्ट मजबूती सुनिश्चित होती है। इसके विपरीत, नायलॉन 6 में अणु श्रृंखलाओं की नियमितता कम होती है, क्रिस्टलीय संरचना अपूर्ण होती है और हाइड्रोजन बांड कमजोर होते हैं। इस वजह से, नायलॉन 6 की मजबूती अपेक्षाकृत कम होती है। उच्च तनाव वाले उत्पादों जैसे रस्सियों, औद्योगिक कैनवास और उच्च-गुणवत्ता वाले चमड़े के सामान के लिए सिलाई धागों में नायलॉन 66 को प्राथमिकता दी जाती है।

नायलॉन 66 की ताप प्रतिरोधक क्षमता नायलॉन 6 से बेहतर होती है। नायलॉन 66 की उच्च क्रिस्टलीयता के कारण, इसके अणु श्रृंखलाएं क्रिस्टलीय क्षेत्रों में सख्त और व्यवस्थित रूप से व्यवस्थित होती हैं। मजबूत हाइड्रोजन बांड और अंतर-आणविक बल गर्म होने पर अणु श्रृंखलाओं की गति को प्रतिबंधित करते हैं। इसके अलावा, एमाइड बांड की उच्च बांड ऊर्जा और हाइड्रोजन बांड नेटवर्क थर्मल स्थिरता को और बढ़ाते हैं। दूसरी ओर, नायलॉन 6 की क्रिस्टलीय संरचना अपूर्ण होती है और अंतर-आणविक बल कमजोर होते हैं, जिसके कारण गर्म होने पर इसके अणु श्रृंखलाएं आसानी से हिलने लगती हैं और थर्मल विरूपण या विघटन हो सकता है। उच्च तापमान वाले वातावरण में उपयोग होने वाले कपड़ों या इंजीनियरिंग प्लास्टिक घटकों, जैसे टायर कॉर्ड और कन्वेयर बेल्ट, में नायलॉन 66 का उपयोग किया जाता है क्योंकि यह उच्च तापमान पर भी स्थिर प्रदर्शन देता है, जबकि नायलॉन 6 की अपर्याप्त ताप प्रतिरोधक क्षमता के कारण इसका प्रदर्शन प्रभावित हो सकता है।

नायलॉन 6 की नमी अवशोषण क्षमता नायलॉन 66 की तुलना में थोड़ी बेहतर होती है। हालांकि नायलॉन 66 भी हाइड्रोजन बांड के माध्यम से पानी के अणुओं के साथ संपर्क कर सकता है और इस प्रकार कुछ नमी अवशोषित कर सकता है, लेकिन नायलॉन 6 की अणु श्रृंखला संरचना पानी के अणुओं के अधिक आसानी से अवशोषण और प्रतिधारण के लिए अनुकूल होती है। नायलॉन 6 के दोहराए जाने वाले यूनिट की संरचना के कारण, इसकी अणु श्रृंखलाओं पर ध्रुवीय समूह पानी के अणुओं के प्रति अधिक आकर्षित होते हैं। समान पर्यावरणीय परिस्थितियों में, नायलॉन 6 अधिक नमी अवशोषित कर सकता है। यह गुण नायलॉन 6 को उन कपड़ों के लिए अधिक उपयुक्त बनाता है जिनमें उच्च नमी अवशोषण क्षमता की आवश्यकता होती है, जैसे कि स्पोर्ट्सवियर। नायलॉन 6 मानव शरीर द्वारा उत्सर्जित पसीने को तेजी से अवशोषित करके बेहतर पहनने वाले आराम प्रदान करता है।

नायलॉन 6 का लचीलापन नायलॉन 66 की तुलना में अपेक्षाकृत बेहतर होता है। नायलॉन 6 में अधिक अक्रिस्टलीय क्षेत्र होते हैं, और इसकी अणु श्रृंखलाओं में अच्छी लचीलापन होती है। जब बाहरी बल लगाया जाता है, तो अक्रिस्टलीय क्षेत्रों में अणु श्रृंखलाएं आसानी से हिल सकती हैं और विकृत हो सकती हैं, जिससे लोचदार संभावित ऊर्जा संग्रहीत होती है। जब बाहरी बल हटा दिया जाता है, तो ये श्रृंखलाएं तुरंत अपनी मूल स्थिति में लौट आती हैं। इसके विपरीत, यदि नायलॉन 66 की क्रिस्टलीयता अत्यधिक उच्च होती है, तो क्रिस्टलीय क्षेत्र अणु श्रृंखलाओं की गति को प्रतिबंधित करते हैं, जिसका इसके लचीलेपन पर प्रभाव पड़ता है। उन इलास्टिक कपड़ों या घटकों में जिन्हें बार-बार खींचने और तेजी से मूल आकार में लौटने की आवश्यकता होती है, नायलॉन 6 का लचीलापन एक स्पष्ट लाभ प्रदान करता है।